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标题: [学习资料] handy-weinberg平衡性检验的卡方值计算方法 分享~~ [打印本页]

作者: wwy    时间: 2011-2-28 11:24     标题: handy-weinberg平衡性检验的卡方值计算方法 分享~~

请教:
handy-weinberg平衡性检验的卡方值怎么计算的吗?其中的B项怎么计算的。三个数字算的,有公式吗?
未命名.jpg

方法一、有强者厉害者已经做出了EXCELL的模板,直接输入三个数字就得出结果了。简单操作,易懂,一定深得临床或者没有学习时间的人才的欢迎。
见附件。


方法二   SAS程序:
基本思路啊:gg gt tt是实际基因型频数,以此算出算出单个等位基因(g和t)的实际频率pg和pt,按照遗传平衡定律,可以分别算出 gg gt tt 的理论基因型频数agg agt att,然后按照拟合优度检验的方法来检验gg gt tt是实际基因型频数和理论基因频数的分布是否存在差异,卡方值为a,再算出算出p值。

data m;
input gg gt tt;
n=gg+gt+tt;
pg=(2*gg+gt)/(2*n);
pt=(2*tt+gt)/(2*n);
agg=pg**2*n;
agt=2*pg*pt*n;
att=pt**2*n;
a=(gg-agg)**2/agg+(gt-agt)**2/agt+(tt-att)**2/att;
p=1-probchi(a,1);
cards;
26 24 6
108 52 21
41 57 7
43 53 30
84 109 54  
23 23 2
59 45 13
61 80 26
;
proc print;
run;

图片附件: 未命名.jpg (2011-2-28 11:23, 64.81 KB) / 下载次数 1
http://cdcman.cn/attachment.php?aid=4629&k=6013a59707614217e70577ba2fb11207&t=1719390421&sid=eGxs9G


作者: wwy    时间: 2011-2-28 11:25

不好意思哈。附件只能上传PDF等格式,excell和word上传不了。
有意者留邮箱吧。
作者: ajackieb    时间: 2011-9-10 16:39

需要EXCEL格式模板,邮箱:Jackiemail2000@163.com.谢谢!




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